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四川农业大学农学院参与的黑麦基因组组装工作获重大突破

时间:2021-05-07 11:56    作者:     点击:

  近来,由四川农业大学农学院教师任天恒参加的黑麦凯发娱真人基因组测序拼装作业取得重大突破,该研讨以题为“高质量基因组拼装杰出黑麦基因组特征和农艺学上重要基因”(A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes)的研讨论文发表于世界尖端刊物《Nature Genetics》,处理了长期以来悬而未决的黑麦基因组精密物理图谱拼装难题,并体系解析了黑麦的演化,淀粉组成、贮存蛋白、抽穗期及驯化等相关基因的具体机制。

  该研讨综合利用多种办法和战略,战胜杂乱基因组拼装的多重妨碍,成功构建了威宁黑麦的高质量精密基因组物理图谱,并解析了其基因组的基本特征和重要农艺性状的相关分子机制。威宁黑麦基因组拼装巨细为7.84G,其间7.25G(93.67%)序列能够锚定到7条染色体上,其间5条染色体巨细超过了1G,最大的染色体长度(2R,1.15G)可达水稻基因组的3.6倍。威宁黑麦中总共注释到45596个高可信度基因,这些基因中有1989个抗病基因,抗病基因的数量高于大麦、水稻和其他麦类二倍体物种。该研讨填补了作物基因组一个重要的缺失环节,为黑麦驯化、麦类基因组演化和比较基因组研讨供给了重要资源。一起也将促进黑麦、小麦等相关麦类作物的遗传育种改进。该研讨得到的黑麦高质量精密基因组物理图谱,是已知拼装完结的最杂乱的二倍体禾本科物种。

  该研讨由河南农业大学联合北京大学、四川农业大学、中国科学院遗传发育研讨所、德国IPK莱布尼兹研讨所和捷克生物技术与农业研讨中心等多家单位协同完结。任天恒副教授为本论文一起榜首作者参加了该研讨,农学院任正隆教授、小麦所颜泽洪教授、研讨生宋中平也参加了该项研讨。

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